More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0080 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  82.99 
 
 
400 aa  683  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  82.99 
 
 
400 aa  683  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  100 
 
 
400 aa  818  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  58.16 
 
 
394 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  54.22 
 
 
395 aa  444  1e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  53.96 
 
 
395 aa  445  1e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  53.65 
 
 
395 aa  440  1e-122  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  53.71 
 
 
527 aa  438  1e-122  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  53.71 
 
 
395 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  53.71 
 
 
395 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  53.71 
 
 
395 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  53.45 
 
 
395 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  54.18 
 
 
423 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  50.75 
 
 
417 aa  408  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  53.92 
 
 
423 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  53.67 
 
 
402 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  54.18 
 
 
423 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  50.51 
 
 
406 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  49.38 
 
 
406 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  52.66 
 
 
397 aa  401  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  50.89 
 
 
423 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  51.27 
 
 
402 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  49.14 
 
 
408 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  51.17 
 
 
423 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  51.44 
 
 
399 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  50.13 
 
 
404 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  48.74 
 
 
416 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  50.51 
 
 
407 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 
415 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  49.11 
 
 
401 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  48.87 
 
 
401 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  49.5 
 
 
406 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  48.61 
 
 
401 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  48.25 
 
 
400 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  46.73 
 
 
407 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  49.25 
 
 
406 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  48.85 
 
 
400 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  48.85 
 
 
400 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  48 
 
 
400 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  47.86 
 
 
403 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  46.78 
 
 
410 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  50.67 
 
 
410 aa  362  5e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  47.47 
 
 
402 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  49.07 
 
 
403 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  49.73 
 
 
401 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  48.08 
 
 
394 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  49.73 
 
 
403 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  45.2 
 
 
410 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  46.84 
 
 
402 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  47.33 
 
 
435 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  46.84 
 
 
402 aa  357  1e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  45.06 
 
 
415 aa  357  2e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  44.5 
 
 
424 aa  357  2e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  47.37 
 
 
403 aa  357  2e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  48.34 
 
 
407 aa  357  2e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  48.35 
 
 
401 aa  356  4e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  46.6 
 
 
402 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  47.09 
 
 
435 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  47.24 
 
 
540 aa  355  6e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  45.68 
 
 
422 aa  355  6e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  47.73 
 
 
401 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  46.08 
 
 
402 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  47.49 
 
 
405 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  49.49 
 
 
397 aa  353  3e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  48.48 
 
 
401 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  47.49 
 
 
406 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47 
 
 
403 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  46.68 
 
 
402 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  46.08 
 
 
401 aa  352  9e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  48.51 
 
 
393 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  46.31 
 
 
399 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
399 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  44.47 
 
 
436 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  43.19 
 
 
441 aa  349  6e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  44.47 
 
 
436 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  46.58 
 
 
401 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  43.99 
 
 
433 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  44.23 
 
 
408 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  44.39 
 
 
437 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  46.87 
 
 
410 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  48.68 
 
 
406 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  44.84 
 
 
401 aa  346  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  49.21 
 
 
388 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  43.55 
 
 
470 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  47.07 
 
 
403 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.2 
 
 
519 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.36 
 
 
402 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  43.55 
 
 
437 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  43.55 
 
 
437 aa  343  3e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  44.47 
 
 
438 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  46.21 
 
 
404 aa  342  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  43.34 
 
 
446 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  43.58 
 
 
400 aa  341  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  44.22 
 
 
446 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  44.74 
 
 
441 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  44.78 
 
 
438 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.22 
 
 
446 aa  340  3e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.22 
 
 
446 aa  340  3e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.22 
 
 
446 aa  340  3e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.22 
 
 
446 aa  340  3e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>