140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0067 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  84.82 
 
 		 192 aa  330  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  84.82 
 
 		 192 aa  330  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  53.72 
 
 		 189 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 190 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  53.97 
 
 		 190 aa  204  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  53.72 
 
 		 189 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  49.74 
 
 		 190 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 		 193 aa  193  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  48.69 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  48.69 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  48.69 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  48.69 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  48.69 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  48.69 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 190 aa  187  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 191 aa  186  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  47.03 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  51.87 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  51.87 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  48.4 
 
 		 190 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  50.83 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  48.35 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  46.03 
 
 		 189 aa  161  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  40.66 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  31.89 
 
 		 798 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  25 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  26.49 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  29.13 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  30.65 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  26.77 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  27.59 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  27.13 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1212  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.279163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  25.62 
 
 		 274 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  25.31 
 
 		 281 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 248 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  24.84 
 
 		 278 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0563  adenine phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0138344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  22.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  21.77 
 
 		 278 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  25.19 
 
 		 274 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  25.19 
 
 		 274 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  25.19 
 
 		 274 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  26.61 
 
 		 272 aa  47.8  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  25.9 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  23.36 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 		 264 aa  45.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>