50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0043 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0043  lysozyme domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2931  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000727334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  29.69 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  29.69 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  29.69 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3576  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0170489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0678  endolysin  29.47 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.320423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2255  endolysin  29.47 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2143  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 331 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2300  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.32 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4364  glycoside hydrolase family 25  27.89 
 
 		 278 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2805  glycosy hydrolase family protein  29.69 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.69 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00849711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2564  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.69 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0333494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2615  glycosy hydrolase family protein  29.69 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2813  putative glycosyl hydrolase, family 25  29.69 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000152496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3024  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.32 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2833  endolysin  27.98 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2848  U32 family peptidase  28.12 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0264815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2869  endolysin  28.65 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00807006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2462  endolysin  27.08 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.568862  normal  0.603316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1394  endolysin  27.6 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000700106 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0755  U32 family peptidase  26.81 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  25.36 
 
 		 574 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  24.89 
 
 		 592 aa  52.8  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0741  endolysin, putative  27.54 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  21.39 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  21.43 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  22.51 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  24.35 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  22.16 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  21.99 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  22.8 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  23.83 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  22.16 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 		 334 aa  45.4  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  21.47 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  21.47 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  22.84 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  24.21 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  22.22 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  26.77 
 
 		 348 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  22.22 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  33.77 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  21 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  22.17 
 
 		 340 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>