More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0032 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
394 aa  795    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  72.77 
 
 
393 aa  609  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  72.77 
 
 
393 aa  609  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  57.76 
 
 
392 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  59.17 
 
 
394 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  58.52 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  57.76 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  58.27 
 
 
393 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
392 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
393 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
392 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
393 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
392 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  57.76 
 
 
393 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
392 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  57.76 
 
 
393 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
393 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  56.74 
 
 
393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
393 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
392 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  56.74 
 
 
392 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
393 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  56.74 
 
 
393 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
393 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
393 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  56.41 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  56.92 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
393 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  57.62 
 
 
395 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  56.23 
 
 
392 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
393 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
395 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
393 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
393 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  55.61 
 
 
392 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  55.22 
 
 
392 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
393 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
393 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
393 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  55.53 
 
 
395 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  54.87 
 
 
394 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
392 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  54.29 
 
 
395 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
392 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  55.98 
 
 
392 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
393 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  54.87 
 
 
394 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  54.62 
 
 
394 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
401 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
392 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.15 
 
 
391 aa  418  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  53.59 
 
 
392 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  53.42 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  53.08 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2086  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.849145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  56.04 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  53.75 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
392 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
390 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  53.33 
 
 
392 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  53.59 
 
 
392 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
393 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
401 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 
393 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0632  acetyl-CoA acetyltransferase  54.96 
 
 
390 aa  408  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3053  acetyl-CoA acetyltransferase  54.36 
 
 
391 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927009  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
390 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
391 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  52.56 
 
 
392 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 
390 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  53.59 
 
 
392 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
399 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 
392 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  53.98 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.94 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  51.54 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>