17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SEA0022 on replicon NC_006663
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  100 
 
 		 214 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p01  hypothetical protein  42.18 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A10  replication initiator protein  35.29 
 
 		 296 aa  89.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00000639536  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p09  hypothetical protein  35.57 
 
 		 297 aa  88.6  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0002  putative RepE  37.76 
 
 		 376 aa  86.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0027  RepE replication protein, putative  30.08 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000188806  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  34.26 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  28.97 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  29.73 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  29.09 
 
 		 381 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  31.96 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  31.96 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  32.5 
 
 		 404 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  30.53 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  25.73 
 
 		 323 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  27.78 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  29.49 
 
 		 315 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>