More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SEA0016 on replicon NC_006663
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  46 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  34.78 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  34.07 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  24.2 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 403 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.91 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  43.86 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  44.26 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>