15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SEA0015 on replicon NC_006663
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  86.16 
 
 
289 aa  523  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  50.74 
 
 
281 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  42.57 
 
 
273 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  33.7 
 
 
281 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  31.54 
 
 
280 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  34.66 
 
 
274 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  37.05 
 
 
275 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 
256 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2758  hypothetical protein  85.37 
 
 
42 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  28.96 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  29.61 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  24.8 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  27.44 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  41.86 
 
 
110 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>