40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2157 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2157  transporter, putative  100 
 
 
278 aa  549  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000281775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0891  putative glucose uptake permease  56.18 
 
 
295 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000919677  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2601  putative glucose uptake permease  57.92 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4853  glucose uptake protein  41.24 
 
 
285 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0407  glucose uptake protein  40.15 
 
 
285 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4829  glucose uptake protein  40.15 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4859  glucose uptake protein  40.51 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4613  glucose uptake protein  40.51 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4969  glucose uptake protein  40.51 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4835  glucose uptake protein  40.15 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4449  glucose uptake protein  40.88 
 
 
285 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4467  glucose uptake protein  40.88 
 
 
285 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5101  putative transporter  40.43 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0184  sugar transport family protein  40.43 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0198  sugar transport family protein  41.88 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4548  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  39.56 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0200  transporter  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0190  glucose uptake protein  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0187  glucose uptake protein  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0225  putative transporter  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0200  transporter  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0242  putative transporter  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0220  glucose uptake protein  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0219  putative transporter  40.79 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3389  DMT superfamily L-rhamnose-proton symporter  38.25 
 
 
285 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0471  putative glucose uptake permease  35.71 
 
 
321 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000523457  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1714  putative glucose uptake permease  36.7 
 
 
315 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0367  glucose uptake protein  36.84 
 
 
251 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0031  sugar transport family protein  35.64 
 
 
287 aa  152  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000014774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1838  sugar transporter, putative  34.39 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00199783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2324  sugar transport family protein  35.02 
 
 
287 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2283  sugar transport family protein  35.02 
 
 
287 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0418  sugar transport family protein  33.21 
 
 
286 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1040  ribose transport protein  29.07 
 
 
296 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0172  putative glucose uptake permease  27.34 
 
 
287 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013856  hitchhiker  4.93934e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2102  hypothetical protein  29.93 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0255  sugar transport family protein  29.03 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0261  sugar transport family protein  29.03 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0662  sugar transport family protein  22.68 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6963  hypothetical protein  35.82 
 
 
104 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>