290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2110 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2110  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 49 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  97.96 
 
 		 49 aa  99.4  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0076  50S ribosomal protein L33  87.76 
 
 		 49 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000689148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 49 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000386724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1029  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 		 54 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000770423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 57 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  54.76 
 
 		 54 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  51.02 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  48.98 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  53.33 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 52 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 51 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  54.76 
 
 		 54 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 54 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0428  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  67.74 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 51 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 51 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1919  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 50 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 51 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1484  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 48 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000298588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 51 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  67.74 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0049  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 51 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754437  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0588  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 51 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.696444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 56 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  64.52 
 
 		 55 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 56 aa  47.4  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 54 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 55 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  64.52 
 
 		 55 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>