More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2073 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2073  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  507  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0165652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 243 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  27.23 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  27.23 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0752  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00012009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  42.67 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1014  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  44.26 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  40.62 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  40.62 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.3 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  25.47 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  33.04 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  25.17 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  31.97 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.52 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  31.86 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  23.18 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  43.75 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  30.08 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.27 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  43.75 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.91 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.47 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  34.38 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>