43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1992 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1038    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  33.71 
 
 
532 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  29.57 
 
 
534 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  30.04 
 
 
540 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  30.77 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  28.62 
 
 
537 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  29.36 
 
 
480 aa  90.1  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  23.68 
 
 
538 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  23.68 
 
 
538 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0334  hypothetical protein  24.49 
 
 
524 aa  84  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  24.22 
 
 
541 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  26.13 
 
 
516 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  37.7 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  27.2 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  24.78 
 
 
484 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  27.87 
 
 
294 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  35.58 
 
 
477 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  22.51 
 
 
263 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.5 
 
 
286 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 
480 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  33.33 
 
 
511 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.54 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  26.52 
 
 
275 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  23.65 
 
 
272 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  20.42 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  23.2 
 
 
290 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  24.3 
 
 
306 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  27.69 
 
 
409 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  27.5 
 
 
293 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  32.29 
 
 
511 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  23.17 
 
 
286 aa  50.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  24.3 
 
 
306 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  21.48 
 
 
746 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  28.37 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  34 
 
 
328 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  21.83 
 
 
496 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  28.22 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  18.91 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  28.57 
 
 
500 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  28.06 
 
 
514 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  26.09 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  34.26 
 
 
632 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  33.93 
 
 
461 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>