More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1938 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  100 
 
 
307 aa  630  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  58.69 
 
 
306 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.59 
 
 
514 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  35.9 
 
 
506 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 
307 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  32.02 
 
 
332 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33 
 
 
349 aa  168  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  35.14 
 
 
317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  32.1 
 
 
333 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 
318 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  33.01 
 
 
316 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  32.59 
 
 
316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  32.59 
 
 
316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  32.59 
 
 
316 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.81 
 
 
316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  32.59 
 
 
316 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  32.27 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 
314 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  31.95 
 
 
316 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.49 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.67 
 
 
323 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.44 
 
 
320 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  31.15 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  31.41 
 
 
298 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  34.35 
 
 
315 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 
311 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  30.42 
 
 
298 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 
312 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  31.39 
 
 
313 aa  142  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.59 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.59 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.25 
 
 
326 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  33.87 
 
 
265 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 
304 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 
311 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 
312 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 
304 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 
358 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 
293 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 
365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  29.31 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 
293 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  31.64 
 
 
311 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  38.86 
 
 
362 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  27.36 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  29 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 
341 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  30.57 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  27.07 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.24 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.02 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  29 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  29.13 
 
 
287 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  27.1 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  29.94 
 
 
317 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  24.57 
 
 
316 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.13 
 
 
347 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 
301 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 
333 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 
278 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
292 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 
353 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 
305 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.95 
 
 
298 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 
313 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25.98 
 
 
306 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 
356 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.51 
 
 
304 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  28.66 
 
 
326 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  25.64 
 
 
310 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.17 
 
 
320 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 
292 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  24.61 
 
 
311 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.15 
 
 
515 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.15 
 
 
515 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 
306 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>