19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1876 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1876  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00409455  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0604  homing nuclease  38.51 
 
 
243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000399673  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0666  homing nuclease  38.51 
 
 
243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787061  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4965  prophage LambdaBa03, HNH endonuclease family protein  37.82 
 
 
269 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00488309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5344  prophage LambdaBa03, HNH endonuclease family protein  37.82 
 
 
269 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000857562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1512  HNH endonuclease family protein  37.11 
 
 
274 aa  80.9  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0327042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1450  HNH endonuclease  37.39 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1962  HNH endonuclease  34.46 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2857  HNH endonuclease  30.39 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000321269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0660  hypothetical protein  34.19 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.22037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4675  NUMOD4 domain-containing protein  33.6 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3568  HNH endonuclease  29.86 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3019  hypothetical protein  32.84 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5063  NUMOD4 domain-containing protein  32.17 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.996691  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3832  NUMOD4 domain-containing protein  32.38 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000542576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2283  HNH endonuclease  37.63 
 
 
159 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  0.082249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4240  NUMOD4 domain protein  31.15 
 
 
223 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0647  hypothetical protein  25.99 
 
 
239 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4224  hypothetical protein  31.71 
 
 
250 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000588859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>