More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1869 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  100 
 
 
437 aa  896    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.78 
 
 
451 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  40.04 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  45.76 
 
 
239 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.02 
 
 
328 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  36.73 
 
 
727 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 
331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  48.81 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  46.3 
 
 
324 aa  166  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  45.73 
 
 
338 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  46.82 
 
 
318 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 
329 aa  160  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  47.31 
 
 
320 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  45.24 
 
 
327 aa  158  2e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  46.51 
 
 
438 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  39.6 
 
 
311 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  44.58 
 
 
460 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  44.58 
 
 
460 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  33.92 
 
 
389 aa  150  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  41.84 
 
 
417 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  40.59 
 
 
320 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  42.62 
 
 
416 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  39.62 
 
 
416 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  40.55 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  41.41 
 
 
657 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  45.45 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  37.62 
 
 
423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  37.14 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0057  phage-related DNA methylase, C-terminal region  52.14 
 
 
114 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  45.93 
 
 
425 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  43.37 
 
 
456 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  41.3 
 
 
319 aa  138  2e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  43.37 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  40.09 
 
 
350 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  41.34 
 
 
348 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  41.85 
 
 
436 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  44.89 
 
 
426 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  37.57 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  44.57 
 
 
373 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  44.68 
 
 
415 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  36.68 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  43.93 
 
 
417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  42.62 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.95 
 
 
313 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  38.64 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  39.55 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  39.55 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  39.55 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  41.01 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  40.83 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  39.55 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  39.55 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  39.55 
 
 
472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  42.13 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  41.62 
 
 
487 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  36.32 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  33 
 
 
352 aa  126  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  35.48 
 
 
447 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.21 
 
 
418 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  39.3 
 
 
491 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  40 
 
 
419 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  40 
 
 
313 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  42.53 
 
 
424 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  41.57 
 
 
413 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  36.7 
 
 
329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  35.46 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  35.54 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  35.64 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  36.16 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  38.18 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  38.18 
 
 
476 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  38.18 
 
 
476 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  38.18 
 
 
476 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  38.18 
 
 
476 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  36.02 
 
 
315 aa  119  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.07 
 
 
236 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
490 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  36.11 
 
 
389 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
446 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.79 
 
 
283 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  34.54 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  37.87 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.29 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.83 
 
 
357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 
335 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  35.76 
 
 
328 aa  110  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 
372 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  38.07 
 
 
418 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  38.07 
 
 
418 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 
385 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 
385 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.32 
 
 
435 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  39.18 
 
 
434 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
373 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  26.65 
 
 
535 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  38.5 
 
 
417 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
468 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  31.4 
 
 
492 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>