38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1762 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  347  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  52.8 
 
 
447 aa  135  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  55.12 
 
 
499 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  57.66 
 
 
455 aa  134  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  34.56 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  39.36 
 
 
390 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  39.36 
 
 
266 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  48.78 
 
 
397 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  38.2 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40.43 
 
 
265 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  30.6 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40.43 
 
 
265 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  34.29 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  34.29 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  35.63 
 
 
300 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  35.63 
 
 
300 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  33.66 
 
 
933 aa  51.6  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  44.83 
 
 
255 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  44.83 
 
 
255 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  34.58 
 
 
512 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.03 
 
 
324 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  42.68 
 
 
267 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  42.68 
 
 
267 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0046  CHAP domain containing protein  33.68 
 
 
332 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.58 
 
 
619 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.58 
 
 
619 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31 
 
 
574 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  30.19 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  41.49 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  41.49 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  36.84 
 
 
449 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  41.38 
 
 
302 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  28.45 
 
 
468 aa  42.4  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  35.64 
 
 
263 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.43 
 
 
655 aa  41.2  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  33.75 
 
 
303 aa  40.8  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>