More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1581 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
289 aa  556  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  77.7 
 
 
294 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  71.18 
 
 
292 aa  413  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  64.93 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  60 
 
 
292 aa  346  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.17 
 
 
293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  58.64 
 
 
302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  61.59 
 
 
293 aa  323  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.6 
 
 
291 aa  321  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  60.34 
 
 
294 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  57.84 
 
 
290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  55.56 
 
 
293 aa  311  7.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.39 
 
 
291 aa  309  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  51.19 
 
 
300 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  51.03 
 
 
294 aa  290  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  57.09 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  56.4 
 
 
291 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  48.8 
 
 
297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  53.59 
 
 
309 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  51.74 
 
 
290 aa  268  7e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  50 
 
 
291 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  48.97 
 
 
293 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  47.32 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  48.64 
 
 
298 aa  251  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  48.67 
 
 
308 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.28 
 
 
298 aa  247  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  46.9 
 
 
300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.21 
 
 
298 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.71 
 
 
299 aa  239  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
298 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  44.11 
 
 
301 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  43.33 
 
 
304 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  44.93 
 
 
300 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  42.23 
 
 
297 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  44.85 
 
 
308 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  47.12 
 
 
299 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  44.85 
 
 
308 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  50.81 
 
 
310 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  51.14 
 
 
310 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  51.14 
 
 
310 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.89 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  48.08 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
301 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.93 
 
 
308 aa  231  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 
301 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.52 
 
 
308 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.52 
 
 
308 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.52 
 
 
308 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.85 
 
 
308 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  45.82 
 
 
300 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
310 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
300 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  43.85 
 
 
308 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  48.14 
 
 
299 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
319 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
319 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  44.26 
 
 
301 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  44.48 
 
 
308 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
308 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.19 
 
 
308 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  44.15 
 
 
308 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.82 
 
 
319 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  44.15 
 
 
300 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.19 
 
 
308 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.52 
 
 
308 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  45.15 
 
 
300 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  44.03 
 
 
304 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
308 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
308 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  43 
 
 
304 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.81 
 
 
308 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
308 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  43.52 
 
 
304 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.13 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  48.47 
 
 
303 aa  225  6e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.44 
 
 
316 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  43.09 
 
 
316 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.81 
 
 
316 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  42.81 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.81 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  42.33 
 
 
307 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  42.96 
 
 
297 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  43.66 
 
 
286 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  43.14 
 
 
311 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  44.48 
 
 
308 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
306 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  41.31 
 
 
338 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  44.48 
 
 
308 aa  221  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>