More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1557 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
632 aa  686    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 
656 aa  778    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
660 aa  784    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
665 aa  1372    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
650 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 
660 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
660 aa  776    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 
660 aa  775    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
657 aa  782    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
655 aa  676    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
648 aa  764    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 
660 aa  774    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 
660 aa  780    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
660 aa  779    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 
660 aa  780    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  61.79 
 
 
675 aa  856    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
660 aa  776    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
657 aa  782    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
659 aa  798    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
650 aa  748    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
653 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
654 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
645 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
645 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
653 aa  659    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
645 aa  643    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  67.86 
 
 
666 aa  935    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
675 aa  761    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
681 aa  798    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
702 aa  798    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  81.71 
 
 
667 aa  1131    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
660 aa  788    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
648 aa  625  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
645 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 
647 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
654 aa  581  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
638 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
664 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
650 aa  574  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
647 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
629 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
629 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
651 aa  550  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
518 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
634 aa  548  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
533 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 
512 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
516 aa  531  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
671 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
509 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
634 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
509 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
510 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
508 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
628 aa  514  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 
509 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
638 aa  515  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
509 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
624 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
636 aa  509  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
629 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
511 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
506 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
644 aa  504  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
648 aa  498  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
632 aa  498  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
663 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
642 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
657 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
670 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
642 aa  478  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
628 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
636 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
640 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
628 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
519 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
648 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
512 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
628 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0187  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
521 aa  457  1e-127  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
516 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
538 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
500 aa  452  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
519 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
519 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
521 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  44.49 
 
 
574 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl036  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
509 aa  441  9.999999999999999e-123  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
523 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
526 aa  441  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
530 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
511 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0035  methionyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
509 aa  438  1e-121  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
530 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
523 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
515 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
516 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>