More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1514 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1514  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
226 aa  460  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3841  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  41.63 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0235  nickel import ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  40.67 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  41.63 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4820  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.15 
 
 
268 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  39.63 
 
 
556 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  43.07 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  36.49 
 
 
543 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 
543 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  38.46 
 
 
268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  39.25 
 
 
544 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3490  ABC transporter related  38.05 
 
 
221 aa  151  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  38.86 
 
 
562 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 
549 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
540 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  36.02 
 
 
549 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  35.71 
 
 
540 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  35.71 
 
 
540 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  35.29 
 
 
540 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  41.21 
 
 
539 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
593 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  34.87 
 
 
540 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  34.87 
 
 
540 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  34.45 
 
 
540 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3009  nickel transporter ATP-binding protein NikE  40.93 
 
 
273 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.208054  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  37.09 
 
 
534 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
601 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  35.81 
 
 
552 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
544 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  35.87 
 
 
631 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  36.16 
 
 
540 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  36.16 
 
 
540 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
549 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  35.68 
 
 
544 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  39.25 
 
 
557 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  37.98 
 
 
527 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  36.16 
 
 
540 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  37.55 
 
 
544 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 
257 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
230 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  34.55 
 
 
555 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 
257 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  34.23 
 
 
547 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3644  ABC transporter related  37.33 
 
 
265 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  36.89 
 
 
565 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  36.17 
 
 
575 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2273  nickel transporter ATP-binding protein NikE  35.75 
 
 
277 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
549 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
549 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
549 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  35.19 
 
 
533 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 
559 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
549 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
549 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
549 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  35.75 
 
 
613 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  35.24 
 
 
516 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  35.59 
 
 
547 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2757  ABC transporter related  36.71 
 
 
253 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
257 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2786  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 
340 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.863606  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
257 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  35.24 
 
 
544 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  35.24 
 
 
544 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  35 
 
 
550 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
257 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  35.32 
 
 
540 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  37.25 
 
 
551 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  35.58 
 
 
285 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  37.39 
 
 
545 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4733  ABC transporter, ATPase subunit  33.77 
 
 
262 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.497706  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0232  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  35.35 
 
 
544 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  34.7 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  36.36 
 
 
572 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  35.68 
 
 
531 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  34.93 
 
 
566 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  38.54 
 
 
585 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  36.76 
 
 
551 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  35.58 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
323 aa  139  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
551 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
336 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.58 
 
 
336 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  32.56 
 
 
342 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  35.78 
 
 
536 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 
321 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  38.42 
 
 
240 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  41.71 
 
 
531 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.68 
 
 
336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  35.75 
 
 
543 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  38.03 
 
 
557 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>