269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1428 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 125 aa  241  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  58.06 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  57.72 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  50.39 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  47.48 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  47.24 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  44.76 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  37.41 
 
 		 142 aa  96.7  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  41.43 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  45.67 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  41.26 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  41.79 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  45.67 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  47.24 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  41.09 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  47.24 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  43.17 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  43.94 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  42.14 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  41.13 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 120 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 120 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  41.3 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  47.29 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  39.5 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  43.41 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  42.45 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  44.26 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  46.88 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  41.18 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  46.23 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  43.61 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  39.57 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  38.41 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  41.54 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  39.85 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  40.48 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  41.18 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  38.03 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  39.29 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  44.78 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  45.31 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  41.94 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  41.48 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  39.01 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  39.39 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  40.91 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  41.09 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  39.16 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  38.3 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  38.93 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  38.3 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  40.85 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  40.58 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  38.03 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  38.69 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  41.79 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  40.6 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  38.03 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  44.03 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  38.41 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  39.04 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  36.81 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  37.98 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  39.42 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  37.32 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  39.1 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  39.71 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  34.75 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  41.04 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  41.04 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  39.04 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  39.04 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  44.36 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  44.36 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  39.07 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  44.36 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  44.36 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  36.17 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  41.04 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>