More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1368 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 94 aa  190  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  95.7 
 
 		 96 aa  181  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  79.79 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  79.79 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  79.79 
 
 		 96 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  83.15 
 
 		 94 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  78.72 
 
 		 96 aa  150  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  81.11 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  80 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  80 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  76.09 
 
 		 95 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  74.47 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 105 aa  141  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 100 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  71.28 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  68.82 
 
 		 103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  70.65 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 		 95 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  68.13 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  67.74 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  63.74 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  61.96 
 
 		 95 aa  116  9e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 92 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 92 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 93 aa  100  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 86 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 86 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  64.79 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>