118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1249 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 
71 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  39.39 
 
 
240 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
321 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  36.11 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  40 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
334 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  43.75 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  37.7 
 
 
200 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  37.1 
 
 
182 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  30.99 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  30.99 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  40.91 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  30.99 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  30.99 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  30.99 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  30.99 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  38.71 
 
 
114 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0020  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  34.25 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  31.51 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  40 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  30.99 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  30.99 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 
212 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  35 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
262 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 
262 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  39.34 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
231 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
474 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  32.73 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  38.6 
 
 
328 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  38.6 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  34.48 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
322 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 
301 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  36.84 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.21 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  35.09 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  36.21 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  28.12 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3294  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.600359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
469 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  34.85 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  36.21 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  36.21 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  36.84 
 
 
143 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 
464 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
359 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
149 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
152 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
469 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  36.51 
 
 
85 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  31.67 
 
 
483 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 
327 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  32.76 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  30.99 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  31.67 
 
 
470 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0910  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.38 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  31.67 
 
 
470 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>