40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1237 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1237  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  908    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.252969  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0476  hypothetical protein  28.08 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000243771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0745  hypothetical protein  28.08 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  25.69 
 
 
476 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581224  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  25.69 
 
 
476 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  0.00000000989665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1835  hypothetical protein  26.49 
 
 
314 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08580  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09850  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09340  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08430  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07130  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12010  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0722624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22880  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08860  hypothetical protein  27.44 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000384305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1356  hypothetical protein  26.37 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08590  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0981  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1109  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00916427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1527  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1922  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1954  hypothetical protein  21.48 
 
 
471 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0069339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2239  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.685977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0780  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0770  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0622  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0407627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0030  hypothetical protein  21.48 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00177404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0420  protein of unknown function UPF0236  25 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000580166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0046  protein of unknown function UPF0236  25 
 
 
467 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00191865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1993  protein of unknown function UPF0236  25 
 
 
467 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000779773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0481  protein of unknown function UPF0236  24.62 
 
 
467 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0817  hypothetical protein  21.71 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0643  protein of unknown function UPF0236  24.62 
 
 
467 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0511  protein of unknown function UPF0236  21.39 
 
 
467 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.935045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2633  protein of unknown function UPF0236  23.73 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2444  protein of unknown function UPF0236  23.73 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1152  protein of unknown function UPF0236  23.73 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1834  hypothetical protein  37.31 
 
 
138 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1163  protein of unknown function UPF0236  21.91 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00489953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0363  protein of unknown function UPF0236  21.51 
 
 
467 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00218859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1837  protein of unknown function UPF0236  23.81 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>