More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1234 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  100 
 
 
306 aa  634    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  58.69 
 
 
307 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  35.9 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  33.63 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 
307 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.9 
 
 
514 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 
314 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.96 
 
 
506 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  34.29 
 
 
318 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 
333 aa  166  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.15 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  34.75 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  34.08 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 
316 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  31.11 
 
 
317 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  31.11 
 
 
317 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  32.58 
 
 
316 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  32.26 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.62 
 
 
323 aa  155  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.26 
 
 
316 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  31.39 
 
 
316 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  32.26 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.26 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  32.26 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  31.94 
 
 
316 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.33 
 
 
320 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  34.22 
 
 
324 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 
331 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  31.27 
 
 
298 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  32.15 
 
 
316 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  31.27 
 
 
298 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 
312 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  30 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.81 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  32.86 
 
 
311 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 
313 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 
287 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  31.06 
 
 
322 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  32.85 
 
 
312 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 
311 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 
293 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 
312 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 
328 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  34.82 
 
 
265 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 
365 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 
318 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  41.32 
 
 
358 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 
311 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 
308 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 
315 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.55 
 
 
302 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  27.13 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.22 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  30.79 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.02 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.39 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 
304 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 
303 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 
306 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 
313 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 
295 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  29.22 
 
 
341 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 
304 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 
304 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  28.39 
 
 
315 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  31.01 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  27.13 
 
 
301 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.12 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  29.72 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  35.67 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.1 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  37.06 
 
 
349 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  27.14 
 
 
311 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  24.5 
 
 
317 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  27.14 
 
 
322 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.61 
 
 
515 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.61 
 
 
515 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 
333 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  28.09 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  28.79 
 
 
313 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  27.44 
 
 
287 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 
311 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 
319 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  28.38 
 
 
310 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 
320 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  26.67 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  28.25 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>