More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1222 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
594 aa  695    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  58.47 
 
 
594 aa  727    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
593 aa  1229    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  58.81 
 
 
594 aa  733    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  58.98 
 
 
594 aa  734    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  58.98 
 
 
594 aa  734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  58.98 
 
 
591 aa  733    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  56.1 
 
 
590 aa  711    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  58.81 
 
 
594 aa  733    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  58.81 
 
 
594 aa  731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  58.31 
 
 
594 aa  720    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  58.81 
 
 
594 aa  725    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  57.97 
 
 
594 aa  719    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  55.9 
 
 
593 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  58.64 
 
 
596 aa  723    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  58.98 
 
 
594 aa  734    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  62.91 
 
 
658 aa  830    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  78 
 
 
595 aa  971    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  55.9 
 
 
593 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  50 
 
 
610 aa  627  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  47.62 
 
 
603 aa  580  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  48.47 
 
 
591 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  45.48 
 
 
600 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  47.36 
 
 
599 aa  547  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  45.07 
 
 
607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  43.23 
 
 
628 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  40.65 
 
 
620 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 
620 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 
607 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 
624 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  40.63 
 
 
616 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 
613 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  39.52 
 
 
625 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  40.73 
 
 
615 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  40.17 
 
 
593 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 
613 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 
619 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  38.05 
 
 
622 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.73 
 
 
641 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  39.7 
 
 
616 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.8 
 
 
627 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 
628 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.69 
 
 
685 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.58 
 
 
629 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.01 
 
 
653 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.36 
 
 
631 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.34 
 
 
613 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 
588 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.07 
 
 
615 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  38.15 
 
 
669 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  37.39 
 
 
665 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  35.29 
 
 
614 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 
611 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.32 
 
 
607 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.42 
 
 
607 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  37.04 
 
 
594 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.58 
 
 
610 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  37.35 
 
 
599 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.81 
 
 
628 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  36.97 
 
 
602 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 
614 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 
607 aa  369  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 
636 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 
596 aa  363  6e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0424  excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 
584 aa  361  2e-98  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.621059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 
596 aa  361  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 
613 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.65 
 
 
604 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  34.58 
 
 
609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 
623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.47 
 
 
649 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  35.95 
 
 
609 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  37.05 
 
 
613 aa  357  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 
609 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  34.87 
 
 
635 aa  356  7.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 
599 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  35.8 
 
 
652 aa  353  5e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  36.83 
 
 
607 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  34.1 
 
 
616 aa  353  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  34.8 
 
 
609 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 
609 aa  352  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 
597 aa  351  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  37.93 
 
 
596 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 
598 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  34.03 
 
 
691 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 
690 aa  349  7e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 
607 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 
677 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  34.41 
 
 
690 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  36.35 
 
 
615 aa  347  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  34.9 
 
 
695 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  35.36 
 
 
610 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 
607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  35.92 
 
 
610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  35.64 
 
 
610 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  34.63 
 
 
695 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
610 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
610 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 
607 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  35.36 
 
 
610 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>