More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1216 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  100 
 
 		 1252 aa  2575    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  52.45 
 
 		 776 aa  834    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  31.01 
 
 		 874 aa  365  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  28.01 
 
 		 852 aa  302  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  28.6 
 
 		 852 aa  300  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  28.6 
 
 		 852 aa  300  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  27.98 
 
 		 850 aa  300  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  29.08 
 
 		 852 aa  299  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  28.34 
 
 		 848 aa  298  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  28.77 
 
 		 852 aa  297  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  28.49 
 
 		 848 aa  295  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  28.43 
 
 		 856 aa  293  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  31.63 
 
 		 928 aa  290  9e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  28.54 
 
 		 852 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  27.25 
 
 		 1043 aa  278  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  27.99 
 
 		 1136 aa  276  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  30.33 
 
 		 655 aa  272  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  30.36 
 
 		 655 aa  272  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.04 
 
 		 2638 aa  271  8e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  29.05 
 
 		 647 aa  264  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.04 
 
 		 1888 aa  257  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  31.46 
 
 		 640 aa  255  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  29.42 
 
 		 640 aa  253  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.03 
 
 		 843 aa  251  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  26.58 
 
 		 843 aa  250  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  29.38 
 
 		 713 aa  243  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  29.06 
 
 		 713 aa  242  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  29.06 
 
 		 713 aa  242  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  29.97 
 
 		 713 aa  241  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  29.2 
 
 		 713 aa  241  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  29.6 
 
 		 713 aa  240  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  28.95 
 
 		 713 aa  240  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  28.89 
 
 		 712 aa  240  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  29.68 
 
 		 825 aa  238  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  28.87 
 
 		 713 aa  238  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  28.75 
 
 		 713 aa  237  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  29.97 
 
 		 601 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  24.86 
 
 		 841 aa  236  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  28.16 
 
 		 713 aa  231  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  27.63 
 
 		 718 aa  230  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  26.42 
 
 		 899 aa  228  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  29.71 
 
 		 766 aa  226  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.26 
 
 		 842 aa  224  8e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  30.02 
 
 		 1064 aa  224  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.63 
 
 		 1117 aa  223  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.9 
 
 		 669 aa  218  8e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  29.53 
 
 		 1064 aa  217  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24.58 
 
 		 1942 aa  199  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.83 
 
 		 891 aa  197  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  28.9 
 
 		 1062 aa  192  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.83 
 
 		 1176 aa  190  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.26 
 
 		 1025 aa  185  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.72 
 
 		 946 aa  184  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  27.05 
 
 		 1429 aa  184  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.47 
 
 		 1331 aa  181  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.72 
 
 		 1035 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.15 
 
 		 1441 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.38 
 
 		 1440 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.38 
 
 		 1440 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.52 
 
 		 1975 aa  171  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  27.57 
 
 		 1432 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.85 
 
 		 1891 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  26.05 
 
 		 998 aa  169  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.91 
 
 		 1855 aa  164  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  25.56 
 
 		 1329 aa  162  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  25.85 
 
 		 1328 aa  162  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.74 
 
 		 2156 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  24.07 
 
 		 991 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.58 
 
 		 2068 aa  155  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  27.61 
 
 		 717 aa  152  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  27.24 
 
 		 817 aa  151  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  25.89 
 
 		 1450 aa  148  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  26.78 
 
 		 1472 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.32 
 
 		 1248 aa  143  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  26.52 
 
 		 706 aa  141  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  27.29 
 
 		 706 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  27.68 
 
 		 693 aa  136  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  27.11 
 
 		 710 aa  135  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  26.32 
 
 		 694 aa  134  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  28.22 
 
 		 723 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  27.37 
 
 		 738 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  24.85 
 
 		 765 aa  132  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  26.51 
 
 		 729 aa  131  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  29.64 
 
 		 690 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  25.65 
 
 		 677 aa  131  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.74 
 
 		 1124 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  27.32 
 
 		 738 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  27.75 
 
 		 723 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  26.34 
 
 		 708 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  24.61 
 
 		 673 aa  130  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  25.89 
 
 		 705 aa  129  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  25.58 
 
 		 691 aa  129  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  24.73 
 
 		 721 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  26.9 
 
 		 694 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  25.06 
 
 		 774 aa  127  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  26.63 
 
 		 718 aa  127  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  26.9 
 
 		 694 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  26.56 
 
 		 779 aa  126  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  25.19 
 
 		 727 aa  126  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  26.46 
 
 		 751 aa  126  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>