More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1212 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  100 
 
 
412 aa  843    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  82.77 
 
 
412 aa  715    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0228  GTPase  57.25 
 
 
414 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1391  GTP-binding protein HSR1-related  47.07 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1365  GTP-binding protein, HSR1-related  46.82 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0434116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  48.88 
 
 
423 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  48.26 
 
 
420 aa  332  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  55.02 
 
 
425 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  55.02 
 
 
354 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  55.02 
 
 
425 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  55.02 
 
 
425 aa  329  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  55.02 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  55.02 
 
 
425 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  54.71 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  54.71 
 
 
425 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0873  GTP-binding protein, putative  46.06 
 
 
416 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  48.02 
 
 
415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  51.71 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  48.1 
 
 
441 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  47.25 
 
 
415 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  49.42 
 
 
421 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  46.13 
 
 
433 aa  289  7e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  39.95 
 
 
435 aa  288  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  52.03 
 
 
428 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  46.69 
 
 
392 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  46.69 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  46.69 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  46.69 
 
 
387 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  46.69 
 
 
387 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  46.69 
 
 
387 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  40.89 
 
 
435 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  46.69 
 
 
387 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  47.63 
 
 
404 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  47.63 
 
 
404 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  46.69 
 
 
387 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  47 
 
 
396 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  47 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  41.32 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  47 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  47 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  47 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  47.66 
 
 
432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  40.3 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  46.69 
 
 
396 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  40.33 
 
 
429 aa  282  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  45.31 
 
 
454 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  42.62 
 
 
454 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  46.37 
 
 
414 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.08 
 
 
401 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.56 
 
 
442 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  47.66 
 
 
396 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  44.72 
 
 
433 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  40.39 
 
 
432 aa  279  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.13 
 
 
436 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  46.77 
 
 
436 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.15 
 
 
433 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  48.32 
 
 
436 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.15 
 
 
433 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.15 
 
 
433 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  41.56 
 
 
435 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 
433 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  40.26 
 
 
407 aa  276  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  46.29 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  40.98 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.87 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  41.32 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  41.32 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.32 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  41.56 
 
 
435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  40.98 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  45.62 
 
 
389 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  50.63 
 
 
414 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  45.48 
 
 
430 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  41.32 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  44.26 
 
 
487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  41.32 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.49 
 
 
421 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  41.08 
 
 
435 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  41.08 
 
 
435 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47 
 
 
417 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  40.74 
 
 
481 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.58 
 
 
441 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.23 
 
 
435 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  41.32 
 
 
435 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  44.81 
 
 
461 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  41.71 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  43.69 
 
 
509 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  43.05 
 
 
419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  46.75 
 
 
450 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  42.15 
 
 
434 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 
502 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  46.75 
 
 
450 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  39.52 
 
 
419 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.58 
 
 
441 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  41.71 
 
 
429 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  44.13 
 
 
432 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  48.82 
 
 
582 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1990  putative GTP-binding protein  45.95 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.0213321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  41.87 
 
 
440 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  39.04 
 
 
419 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>