142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1189 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  663    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  65.28 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  42.91 
 
 
328 aa  243  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  38.58 
 
 
347 aa  240  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  39.88 
 
 
334 aa  238  8e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  38.68 
 
 
331 aa  236  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  40.48 
 
 
337 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  40 
 
 
329 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  37.42 
 
 
329 aa  215  8e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  38.89 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  37.16 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.82 
 
 
584 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  35.02 
 
 
317 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  38.01 
 
 
321 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  35.59 
 
 
317 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  38.97 
 
 
322 aa  205  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  38.54 
 
 
322 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.68 
 
 
321 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  40.71 
 
 
320 aa  202  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  35.52 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  35.05 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  35.52 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  36.81 
 
 
321 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.01 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  36.7 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.4 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  34.27 
 
 
319 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  31.19 
 
 
324 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.66 
 
 
325 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  37.46 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  38.03 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  35.69 
 
 
331 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  31.06 
 
 
324 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  31.79 
 
 
324 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  32.72 
 
 
338 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  33.54 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  31.86 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  32.33 
 
 
343 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  31.06 
 
 
325 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  36.46 
 
 
335 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  33.45 
 
 
349 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  31.25 
 
 
323 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  31.25 
 
 
325 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  32.77 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  32.54 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  32.54 
 
 
326 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  32.43 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  28.52 
 
 
327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  33.11 
 
 
370 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  31.86 
 
 
329 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  32.24 
 
 
349 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  31.77 
 
 
323 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  29.81 
 
 
331 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  30.9 
 
 
323 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  29.69 
 
 
323 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  32.09 
 
 
336 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  30.21 
 
 
322 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  32.09 
 
 
321 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  29.35 
 
 
344 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  33.45 
 
 
332 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  31.38 
 
 
321 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  31.38 
 
 
321 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  30.21 
 
 
322 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  31.38 
 
 
321 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.42 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 
323 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  31.03 
 
 
321 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  31.76 
 
 
337 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  32.77 
 
 
332 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  30.98 
 
 
322 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  33.02 
 
 
330 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 
323 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 
323 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 
323 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 
323 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.43 
 
 
323 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  32.08 
 
 
320 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  32.41 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  28.19 
 
 
340 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  31.16 
 
 
313 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  30.65 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  29.88 
 
 
322 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  27.25 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  25.55 
 
 
640 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  26.81 
 
 
315 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.08 
 
 
328 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.17 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  24.48 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.97 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  21.19 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  25.09 
 
 
324 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  27.97 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  23.99 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  23.7 
 
 
320 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  25.84 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2525  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.77 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.75 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  22.05 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  25.61 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>