More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1116 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
187 aa  390  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 
188 aa  271  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  65.03 
 
 
188 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 
189 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  62.3 
 
 
189 aa  261  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  61.54 
 
 
185 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  60.54 
 
 
188 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  57.92 
 
 
185 aa  246  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  57.84 
 
 
207 aa  245  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 
188 aa  245  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  57.84 
 
 
206 aa  241  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  57.84 
 
 
190 aa  240  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  55.98 
 
 
192 aa  240  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 
188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 
187 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 
198 aa  237  6.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 
207 aa  236  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  56.83 
 
 
189 aa  234  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  57.53 
 
 
206 aa  232  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 
189 aa  232  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
202 aa  231  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
194 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
202 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
201 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 
193 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
201 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
199 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  56.76 
 
 
201 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  57.61 
 
 
194 aa  228  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 
222 aa  228  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  57.78 
 
 
219 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 
195 aa  227  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
210 aa  227  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 
214 aa  226  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 
202 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
200 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
209 aa  224  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  56.28 
 
 
214 aa  225  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 
200 aa  224  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 
198 aa  223  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 
187 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 
219 aa  222  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  56.83 
 
 
195 aa  221  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 
188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 
257 aa  221  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 
216 aa  220  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 
227 aa  219  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 
234 aa  218  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 
185 aa  218  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7919  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 
202 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 
220 aa  217  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 
219 aa  215  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  53.01 
 
 
217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 
205 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 
219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  52.78 
 
 
200 aa  211  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  50.27 
 
 
198 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 
247 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
195 aa  204  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 
214 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 
214 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 
239 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 
239 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  51.06 
 
 
213 aa  201  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
213 aa  197  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 
235 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 
218 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 
235 aa  197  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 
195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  53.04 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  48.13 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  50.54 
 
 
243 aa  194  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 
223 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  47.85 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 
187 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  47.31 
 
 
219 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 
223 aa  194  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 
213 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 
216 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  50.57 
 
 
202 aa  193  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>