More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1095 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  100 
 
 
223 aa  456  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  84.09 
 
 
224 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  62.27 
 
 
217 aa  291  6e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  66.34 
 
 
226 aa  280  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  63.37 
 
 
212 aa  265  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  64.36 
 
 
212 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  62.69 
 
 
212 aa  262  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  62.87 
 
 
212 aa  262  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  62.38 
 
 
212 aa  261  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  62.38 
 
 
212 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  62.38 
 
 
215 aa  261  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  62.38 
 
 
212 aa  261  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  62.38 
 
 
212 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  62.38 
 
 
212 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  62.38 
 
 
212 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  62.38 
 
 
212 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  62.87 
 
 
210 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  59.09 
 
 
208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  57.29 
 
 
263 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  57.29 
 
 
263 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  57.87 
 
 
211 aa  241  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  57.87 
 
 
211 aa  241  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  58.38 
 
 
211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  56.61 
 
 
191 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  47.62 
 
 
267 aa  208  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  41.15 
 
 
216 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  39 
 
 
216 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.1 
 
 
216 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.1 
 
 
216 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  39 
 
 
216 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.62 
 
 
216 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  40.1 
 
 
216 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  40.21 
 
 
216 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  41.44 
 
 
239 aa  147  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  39 
 
 
247 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  34.68 
 
 
313 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  41.8 
 
 
204 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  39.01 
 
 
274 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  34.68 
 
 
250 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  37.25 
 
 
271 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  37.44 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  36.67 
 
 
256 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  40.52 
 
 
224 aa  131  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  35.94 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  37.36 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  36.31 
 
 
277 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  35.29 
 
 
230 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  35.83 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  34.05 
 
 
233 aa  118  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  35.71 
 
 
269 aa  115  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  33.16 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  34.59 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  33.16 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  35 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  35.76 
 
 
247 aa  108  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  34.95 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  33.96 
 
 
208 aa  101  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  28.93 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.85 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  30.46 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.46 
 
 
846 aa  62  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0343  putative RelA/SpoT family protein  38.02 
 
 
846 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000094604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  32.34 
 
 
577 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0383  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.52 
 
 
897 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000110921  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  36.07 
 
 
759 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  27.12 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.96 
 
 
793 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  30 
 
 
373 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  32.41 
 
 
388 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  40.45 
 
 
341 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2442  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.14 
 
 
730 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  35.51 
 
 
775 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.091974 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  34.43 
 
 
774 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  29.61 
 
 
329 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.21 
 
 
781 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  30.41 
 
 
369 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2868  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  37.38 
 
 
719 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706713  normal  0.0333863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.36 
 
 
804 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3527  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.99 
 
 
701 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982777  normal  0.148068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  31.71 
 
 
1046 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1856  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.2 
 
 
715 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.709628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3048  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.17 
 
 
815 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1186  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.62 
 
 
721 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000400543  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  25.67 
 
 
356 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  31.71 
 
 
743 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  25.67 
 
 
356 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.61 
 
 
722 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.08 
 
 
727 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  27.37 
 
 
268 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  27.37 
 
 
268 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
797 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  32.79 
 
 
705 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5139  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
879 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1376  (p)ppGpp synthetase I  29.49 
 
 
862 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  0.0959859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.79 
 
 
705 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.7 
 
 
750 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.97 
 
 
705 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>