254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1083 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  855    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  74.63 
 
 
403 aa  625  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1806  oxidoreductase, putative, truncated  75.88 
 
 
241 aa  373  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  30.5 
 
 
416 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  49.19 
 
 
267 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  48.31 
 
 
202 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  47.25 
 
 
203 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  46.51 
 
 
180 aa  168  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  44.39 
 
 
200 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  41.99 
 
 
184 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  44.97 
 
 
227 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
184 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
189 aa  99  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  33.71 
 
 
186 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
185 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  31.72 
 
 
220 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  30.64 
 
 
184 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 
184 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  30.64 
 
 
184 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
188 aa  93.2  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.78 
 
 
182 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
192 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  33.15 
 
 
188 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  33.15 
 
 
188 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  32.6 
 
 
188 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  33.15 
 
 
188 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 
185 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  32.6 
 
 
188 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  32.6 
 
 
194 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 
187 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  32.04 
 
 
188 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  32.04 
 
 
188 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  32.04 
 
 
188 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
181 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  30.32 
 
 
203 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  32.04 
 
 
188 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
206 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
193 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  32.18 
 
 
184 aa  86.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
183 aa  86.3  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  30.64 
 
 
183 aa  86.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  29.89 
 
 
184 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
184 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
183 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  30.68 
 
 
184 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  30.06 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  30.06 
 
 
184 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  32.3 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.09 
 
 
180 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  28.98 
 
 
183 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  28.98 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
186 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  30.34 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  32.95 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.3 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2828  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
194 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  32.76 
 
 
179 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  30.06 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
186 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  27.75 
 
 
189 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  26.37 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  25.43 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  25.82 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 
185 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  28.9 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2299  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
181 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197396  hitchhiker  0.00422295 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>