More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1081 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  100 
 
 		 312 aa  639    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  53.45 
 
 		 297 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  52.1 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  43.71 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  41.23 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  39.4 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  39.54 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  40.91 
 
 		 342 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  40.39 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  39.09 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  42.37 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  38.51 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  42.54 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  37.46 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  40.38 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  36.16 
 
 		 360 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  36.04 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  35.23 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  30.65 
 
 		 361 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  29.7 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.77 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.12 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  35.2 
 
 		 371 aa  166  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.64 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.26 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.58 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.97 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.63 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  29.54 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 379 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.92 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.64 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 		 336 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  29.35 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  28.85 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  26.58 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  28.43 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.01 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  24.53 
 
 		 386 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  27.78 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.42 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  26.12 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  26.76 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  25.89 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  26.64 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.45 
 
 		 350 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.04 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  25.57 
 
 		 369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  27.95 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  26.2 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.33 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  25.4 
 
 		 344 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  26.25 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.84 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  23.93 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  27.24 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  25.16 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.09 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  23.84 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.01 
 
 		 343 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1418  apbE family protein  26.75 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2090  ApbE family lipoprotein  26.52 
 
 		 427 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  23.1 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.56 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  24.28 
 
 		 346 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  24.28 
 
 		 346 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.92 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  27.01 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  26.37 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  25.24 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.67 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.75 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.95 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.32 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.57 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  26.51 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.57 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  26.05 
 
 		 338 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.57 
 
 		 350 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.9 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  25.38 
 
 		 343 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.19 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  25.73 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  24.92 
 
 		 344 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  25.19 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.19 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  24.01 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  27.66 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.19 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>