More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1012 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  100 
 
 		 253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  68.77 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  66.53 
 
 		 258 aa  308  8e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  52.99 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  53.39 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  49.8 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  54.35 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  49.8 
 
 		 277 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  50.2 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  52.99 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  53.39 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  52.19 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  52.19 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  52.59 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  52.19 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  51.19 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  48.41 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  48.41 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  51.39 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  55.9 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  46.83 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 338 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.64 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  42.35 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  49.28 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  50 
 
 		 216 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  39.92 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  52.22 
 
 		 209 aa  188  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  41.05 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  40.61 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  47.55 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  42.8 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50 
 
 		 210 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.19 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  48.22 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  47.8 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  51.01 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  44.44 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 208 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.11 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 208 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  44.97 
 
 		 198 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  48.39 
 
 		 204 aa  169  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  46.39 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  44.62 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  38.12 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.06 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 218 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.06 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  46.03 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  49.24 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  40.89 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  45.26 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  50 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  50 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 217 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 208 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  40.44 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 198 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>