More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0923 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  100 
 
 		 639 aa  1320    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  76.53 
 
 		 639 aa  1034    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0034  truncated tetracycline resistance protein  71.01 
 
 		 346 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  35.5 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  36.02 
 
 		 647 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  35.84 
 
 		 647 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  35.99 
 
 		 647 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  36.31 
 
 		 647 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  36.55 
 
 		 647 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  35.46 
 
 		 647 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  36.79 
 
 		 647 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  35.83 
 
 		 647 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  36.55 
 
 		 647 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  34.94 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  34.64 
 
 		 656 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 657 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0035  truncated tetracycline resistance protein  67.35 
 
 		 288 aa  345  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.889481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 632 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  34.73 
 
 		 662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  33.9 
 
 		 651 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  32.28 
 
 		 647 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  32.31 
 
 		 652 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  30.72 
 
 		 888 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  30.27 
 
 		 880 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  28.27 
 
 		 690 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  29.13 
 
 		 640 aa  258  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  28.82 
 
 		 689 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  27.15 
 
 		 697 aa  256  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  28.3 
 
 		 683 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  29.49 
 
 		 646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  27.72 
 
 		 691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  29.87 
 
 		 882 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  27.36 
 
 		 691 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  26.49 
 
 		 693 aa  253  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.69 
 
 		 691 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  27.19 
 
 		 698 aa  252  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  30.18 
 
 		 885 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  27.1 
 
 		 704 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  27.27 
 
 		 691 aa  250  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  27.57 
 
 		 691 aa  250  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  26.59 
 
 		 693 aa  249  8e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  27.14 
 
 		 692 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  27.84 
 
 		 691 aa  249  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0796  elongation factor G  28.44 
 
 		 695 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0475216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  27.42 
 
 		 695 aa  249  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0770  elongation factor G  28.44 
 
 		 695 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  27.2 
 
 		 697 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  27.18 
 
 		 678 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  28.2 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  26.95 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  26.95 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  27.69 
 
 		 699 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  28.49 
 
 		 690 aa  248  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  26.75 
 
 		 694 aa  248  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  28.86 
 
 		 646 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  26.8 
 
 		 704 aa  247  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  26.52 
 
 		 691 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  28.44 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  26.52 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  26.52 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  26.52 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  26.52 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.87 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  27.79 
 
 		 693 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  26.52 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  28.15 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  26.52 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  26.79 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  26.87 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  27.87 
 
 		 694 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  26.52 
 
 		 692 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  26.36 
 
 		 692 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0721  elongation factor G  28.21 
 
 		 694 aa  244  3e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.062401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  26.79 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  28.66 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  28.36 
 
 		 695 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  27.23 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  26.79 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  27.09 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  27.27 
 
 		 706 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  26.67 
 
 		 695 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  26.36 
 
 		 692 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  26.36 
 
 		 692 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  26.84 
 
 		 706 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  27.59 
 
 		 691 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  27.03 
 
 		 690 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  26.36 
 
 		 692 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.01 
 
 		 692 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  27.34 
 
 		 701 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  28.21 
 
 		 695 aa  243  7e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  27.14 
 
 		 704 aa  243  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  26.74 
 
 		 692 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  27.78 
 
 		 690 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  25.78 
 
 		 692 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  28.64 
 
 		 692 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  27.29 
 
 		 689 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  27.12 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  27.12 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  26.58 
 
 		 695 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  27.79 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>