39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0857 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
66 aa  127  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  87.69 
 
 
65 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1939  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000147682  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.02 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  45.1 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  45.1 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  45.1 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  43.14 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  36.67 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  35 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  33.33 
 
 
90 aa  42  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 
87 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  35.59 
 
 
82 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  35.59 
 
 
82 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  35.59 
 
 
82 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>