More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0762 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  100 
 
 
398 aa  801    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.76 
 
 
395 aa  634    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  82.91 
 
 
395 aa  655    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  94.97 
 
 
398 aa  742    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  76.2 
 
 
396 aa  631  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  633  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.37 
 
 
394 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.37 
 
 
394 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.37 
 
 
394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.37 
 
 
394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  74.62 
 
 
394 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  74.62 
 
 
394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  74.37 
 
 
394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.12 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.12 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.12 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  74.37 
 
 
394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.73 
 
 
394 aa  609  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.12 
 
 
396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  73.07 
 
 
399 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.82 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.46 
 
 
397 aa  607  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  73.87 
 
 
396 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.82 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.7 
 
 
399 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  72.8 
 
 
395 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  70.82 
 
 
400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.44 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.44 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.51 
 
 
395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.51 
 
 
395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.46 
 
 
399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0627  elongation factor Tu  74.81 
 
 
395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.68 
 
 
400 aa  598  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  72.8 
 
 
394 aa  598  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  72.86 
 
 
396 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.71 
 
 
397 aa  597  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.86 
 
 
396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  75.51 
 
 
395 aa  600  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  71.11 
 
 
396 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  71.11 
 
 
396 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0651  elongation factor Tu  75.63 
 
 
396 aa  600  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000337363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  73.12 
 
 
396 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  71.61 
 
 
395 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  71.61 
 
 
395 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.86 
 
 
396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.32 
 
 
400 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.32 
 
 
400 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  72 
 
 
396 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  72.11 
 
 
396 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  72.11 
 
 
396 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  72.73 
 
 
395 aa  595  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  72 
 
 
396 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  70.97 
 
 
400 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  71.25 
 
 
396 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  71.25 
 
 
396 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  71.86 
 
 
396 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.57 
 
 
399 aa  597  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71 
 
 
396 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71 
 
 
396 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.96 
 
 
397 aa  596  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  67.49 
 
 
405 aa  592  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  70.71 
 
 
395 aa  591  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  73.07 
 
 
399 aa  592  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  72.11 
 
 
396 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  71.32 
 
 
399 aa  593  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  73.37 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  73.37 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.07 
 
 
400 aa  592  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  71.86 
 
 
396 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  71.86 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  71.86 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.57 
 
 
399 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.57 
 
 
399 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  67.49 
 
 
405 aa  592  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  71.61 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>