More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0723 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  68.28 
 
 
229 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  55.8 
 
 
231 aa  259  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  50.64 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  49.36 
 
 
246 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  49.33 
 
 
231 aa  218  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  214  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  49.54 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  49.07 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  49.07 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  44.3 
 
 
233 aa  211  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  51.74 
 
 
241 aa  207  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  42.74 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  48.43 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  42.74 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  48.58 
 
 
226 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  47.3 
 
 
259 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  44.39 
 
 
245 aa  191  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  44.8 
 
 
241 aa  190  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  44.8 
 
 
241 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  45.73 
 
 
236 aa  187  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  42.06 
 
 
235 aa  184  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  44.59 
 
 
228 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.1 
 
 
246 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  46.4 
 
 
227 aa  180  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  42.48 
 
 
233 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  45.12 
 
 
236 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  41.71 
 
 
236 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  43.48 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.15 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  43.48 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  40.62 
 
 
235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  44 
 
 
230 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  43.48 
 
 
229 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.48 
 
 
231 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  42.72 
 
 
383 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.72 
 
 
383 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  40.68 
 
 
233 aa  168  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  43.17 
 
 
245 aa  168  8e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  40.81 
 
 
236 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  42.25 
 
 
385 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  43.12 
 
 
221 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.25 
 
 
230 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  41.26 
 
 
377 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.74 
 
 
246 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  44.86 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  42.41 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  41.55 
 
 
237 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  42.34 
 
 
225 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  42.34 
 
 
225 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  39.62 
 
 
260 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  41.52 
 
 
240 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  40.85 
 
 
223 aa  159  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  44.39 
 
 
246 aa  157  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  39.55 
 
 
248 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.48 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  37.79 
 
 
237 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.06 
 
 
238 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  37.13 
 
 
234 aa  154  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.3 
 
 
223 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  41.4 
 
 
240 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.95 
 
 
246 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40 
 
 
223 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  40.65 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.71 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.09 
 
 
248 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  39.11 
 
 
222 aa  152  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.29 
 
 
226 aa  152  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.94 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.55 
 
 
237 aa  151  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  41.33 
 
 
243 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  41.04 
 
 
282 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  38.76 
 
 
234 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  40.81 
 
 
248 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  39.3 
 
 
227 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  37.56 
 
 
231 aa  149  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  40.99 
 
 
243 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  36.82 
 
 
246 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  40.65 
 
 
242 aa  148  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  40.91 
 
 
273 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  43.84 
 
 
228 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  43.15 
 
 
276 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  42.4 
 
 
243 aa  148  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  41.05 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  40.17 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  40.1 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  41.01 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  36.62 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.67 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  41.15 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  42.73 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  40.98 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  36.84 
 
 
234 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>