54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0548 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  34.94 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  34.94 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  34.72 
 
 		 217 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  28.74 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0555  immunity repressor protein  37.14 
 
 		 153 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000943913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.12 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.17 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.87 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  32.56 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  30.36 
 
 		 149 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  22.14 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 97 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.04 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.02 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 107 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  30.11 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  30.11 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  30.11 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  30.11 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.76 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 		 106 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  26.76 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1364  putative phage repressor  26.24 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0666376  normal  0.101341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  30.88 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  27.4 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  30.88 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  24.77 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  38.78 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  30 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  37.5 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  31.33 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  25.6 
 
 		 210 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  30.12 
 
 		 467 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  31.25 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 198 aa  42  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  30.7 
 
 		 158 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>