291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0382 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0382  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  87.72 
 
 		 117 aa  206  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  62.83 
 
 		 119 aa  150  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0700  ribosome-binding factor A  51.75 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00262073  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  50.44 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0434  ribosome-binding factor A  47.75 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  42.48 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  47.46 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  44.07 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  44.07 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  39.66 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  40.71 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  40.74 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 118 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 118 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  40.35 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  38.4 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  43.52 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  36.44 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  37.29 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  39.13 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  38.68 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  36.84 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  38.32 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  35.78 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0991  ribosome-binding factor A  33.94 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00061052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  31.03 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0327  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  34.91 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  37.37 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  33.04 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0630  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  29.36 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>