More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0317 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0317  sun protein  100 
 
 
440 aa  906    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  70.09 
 
 
442 aa  617  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  50.92 
 
 
424 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  43.79 
 
 
444 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  44.14 
 
 
447 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  42.92 
 
 
449 aa  360  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  43.65 
 
 
444 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  43.43 
 
 
444 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  42.98 
 
 
444 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  43.43 
 
 
444 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  43.43 
 
 
444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  43.43 
 
 
444 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  43.21 
 
 
444 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  43.21 
 
 
444 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  43.21 
 
 
444 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  43.21 
 
 
444 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  42.76 
 
 
444 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  40.54 
 
 
448 aa  336  5e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  41.36 
 
 
435 aa  328  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  41.36 
 
 
435 aa  328  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  44.12 
 
 
438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  39 
 
 
435 aa  308  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  39.91 
 
 
444 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.38 
 
 
453 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.29 
 
 
442 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  35.07 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.51 
 
 
455 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  37 
 
 
452 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  37.36 
 
 
452 aa  269  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  34.82 
 
 
452 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  36.24 
 
 
449 aa  266  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  33.11 
 
 
457 aa  253  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  34.9 
 
 
448 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  34.82 
 
 
448 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.19 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  33.41 
 
 
453 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.56 
 
 
446 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  33.92 
 
 
451 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.32 
 
 
448 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.81 
 
 
462 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  34.61 
 
 
440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.07 
 
 
449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  32.29 
 
 
451 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  33.41 
 
 
456 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.36 
 
 
452 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  34.6 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.59 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.59 
 
 
451 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  32.6 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  36.2 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  36.6 
 
 
431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.97 
 
 
451 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.99 
 
 
449 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.46 
 
 
406 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.63 
 
 
443 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  33.41 
 
 
428 aa  206  5e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  36.12 
 
 
462 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  31.93 
 
 
451 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  31.8 
 
 
428 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  33.04 
 
 
464 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  31.42 
 
 
428 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  31.72 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  31.72 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  31.57 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  31.72 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  31.72 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  31.72 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  31.72 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  30.36 
 
 
443 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  31.8 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  32.92 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  30.62 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  31.22 
 
 
432 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  31.5 
 
 
429 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  31.14 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  31.5 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.28 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  31.19 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  32.19 
 
 
428 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  31.42 
 
 
429 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  31.14 
 
 
429 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  31.28 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  31.22 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  29.67 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.16 
 
 
446 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  30.68 
 
 
429 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  30.91 
 
 
428 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  31.12 
 
 
429 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  29.48 
 
 
501 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  31.58 
 
 
429 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  31.58 
 
 
429 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  30.98 
 
 
450 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.11 
 
 
428 aa  194  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  31.78 
 
 
438 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  30.3 
 
 
426 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  31.35 
 
 
435 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  31.41 
 
 
429 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  31.78 
 
 
427 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  31.41 
 
 
429 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  31.07 
 
 
436 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>