More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0298 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 750 aa  1528    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  63.03 
 
 		 773 aa  869    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  50.67 
 
 		 623 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  44.27 
 
 		 791 aa  524  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  43.4 
 
 		 754 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.63 
 
 		 730 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  39.13 
 
 		 912 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.03 
 
 		 879 aa  438  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  38.76 
 
 		 836 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  39.55 
 
 		 846 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  39.55 
 
 		 820 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  39.4 
 
 		 834 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  39.55 
 
 		 834 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  39.4 
 
 		 835 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  38.86 
 
 		 837 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  38.4 
 
 		 830 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  38.25 
 
 		 832 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  36.8 
 
 		 794 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  38.92 
 
 		 837 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  38.61 
 
 		 901 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 		 839 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  37.92 
 
 		 865 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  37.44 
 
 		 897 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 897 aa  363  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  37.36 
 
 		 905 aa  362  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  37.04 
 
 		 897 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  37.04 
 
 		 896 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  37.04 
 
 		 897 aa  361  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  37.04 
 
 		 897 aa  361  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  36.43 
 
 		 900 aa  360  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  37.26 
 
 		 647 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  35.85 
 
 		 914 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  33.53 
 
 		 880 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.43 
 
 		 765 aa  317  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 		 795 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 727 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 727 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.19 
 
 		 905 aa  307  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  32.34 
 
 		 743 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.78 
 
 		 727 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  34.76 
 
 		 709 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  34.88 
 
 		 727 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.32 
 
 		 828 aa  291  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  30.95 
 
 		 814 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.79 
 
 		 761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  32.11 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  33.6 
 
 		 673 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  33.6 
 
 		 673 aa  282  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 667 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.44 
 
 		 680 aa  281  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.07 
 
 		 680 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  34.07 
 
 		 680 aa  280  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 680 aa  280  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 680 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.39 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 679 aa  272  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.35 
 
 		 806 aa  266  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  33.16 
 
 		 706 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  32.06 
 
 		 646 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  31.42 
 
 		 941 aa  260  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 829 aa  257  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  31.75 
 
 		 721 aa  257  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  30.37 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  29.32 
 
 		 824 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.09 
 
 		 649 aa  253  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  30.82 
 
 		 820 aa  251  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 830 aa  250  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  29.49 
 
 		 861 aa  248  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  29.98 
 
 		 705 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  29.98 
 
 		 705 aa  244  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  29.98 
 
 		 705 aa  244  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  29.98 
 
 		 705 aa  244  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.58 
 
 		 676 aa  243  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.12 
 
 		 761 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  29.83 
 
 		 705 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  29.61 
 
 		 705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  30.03 
 
 		 746 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 746 aa  241  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.69 
 
 		 645 aa  240  6.999999999999999e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  30.88 
 
 		 642 aa  239  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.01 
 
 		 743 aa  238  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  29.52 
 
 		 705 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  29.35 
 
 		 679 aa  238  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  29.6 
 
 		 705 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  32.45 
 
 		 656 aa  237  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  30.22 
 
 		 708 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.81 
 
 		 687 aa  233  8.000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  28.95 
 
 		 638 aa  233  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.66 
 
 		 685 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  27.34 
 
 		 705 aa  231  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.55 
 
 		 642 aa  230  7e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  29.67 
 
 		 843 aa  229  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.07 
 
 		 751 aa  228  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  28.99 
 
 		 643 aa  228  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  29.53 
 
 		 775 aa  227  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  28.4 
 
 		 643 aa  226  8e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  28.4 
 
 		 643 aa  226  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  29 
 
 		 773 aa  226  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  30.31 
 
 		 665 aa  225  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  28.93 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>