More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0260 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.77 
 
 		 245 aa  248  7e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.66 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  47.6 
 
 		 241 aa  228  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  47.66 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  46.55 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  36.86 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  38.64 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 312 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  37.77 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.56 
 
 		 510 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  39.3 
 
 		 580 aa  171  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  35.47 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  36.82 
 
 		 583 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  35.62 
 
 		 275 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  38.86 
 
 		 580 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  37.34 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  42.38 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  34.91 
 
 		 247 aa  168  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  38.33 
 
 		 299 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.16 
 
 		 323 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  37.71 
 
 		 575 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  34.48 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  36.94 
 
 		 314 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  33.62 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.83 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.47 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  35.98 
 
 		 581 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  42.33 
 
 		 284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 		 320 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  37.87 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  39.47 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  40 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 320 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  34.63 
 
 		 325 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 311 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  34.63 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  36.71 
 
 		 582 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 317 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  35.17 
 
 		 322 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.39 
 
 		 329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.1 
 
 		 325 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 576 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.2 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  35.15 
 
 		 582 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  37.04 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  37.71 
 
 		 578 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 319 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.19 
 
 		 339 aa  161  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  34.62 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  36.44 
 
 		 579 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  39.44 
 
 		 311 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  36.12 
 
 		 319 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  35.19 
 
 		 322 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  35.56 
 
 		 585 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  38.91 
 
 		 579 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.61 
 
 		 283 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  35.32 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  41.67 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  38.97 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  38.64 
 
 		 594 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  37.72 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  35.44 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  38.16 
 
 		 327 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  33.76 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  38.91 
 
 		 580 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  37.61 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.72 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  37.13 
 
 		 590 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  35.15 
 
 		 576 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 580 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  36.17 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  37.97 
 
 		 590 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 578 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0288  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.63 
 
 		 327 aa  158  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467891  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 578 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 328 aa  158  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>