More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0122 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
223 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
223 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  49.55 
 
 
223 aa  231  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  46.64 
 
 
223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  45.96 
 
 
223 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.5 
 
 
259 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  43.44 
 
 
225 aa  185  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0812  peptide ABC transporter ATPase  42.53 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000112788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
227 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  42.48 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.74 
 
 
242 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  38.67 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  41.63 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  43.17 
 
 
225 aa  179  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  41.85 
 
 
646 aa  178  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  37.5 
 
 
225 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  37.5 
 
 
225 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 
242 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.91 
 
 
240 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  39.64 
 
 
240 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 
222 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  42.27 
 
 
222 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
648 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
230 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1857  ABC transporter related  42.92 
 
 
229 aa  175  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  37.84 
 
 
240 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.11 
 
 
648 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.11 
 
 
648 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1348  peptide ABC transporter ATPase  44.19 
 
 
224 aa  175  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.926754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  43.11 
 
 
648 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.11 
 
 
648 aa  175  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  43.11 
 
 
648 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.11 
 
 
648 aa  175  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.99 
 
 
239 aa  174  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1049  peptide ABC transporter ATPase  43.26 
 
 
224 aa  175  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.3 
 
 
648 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  41.82 
 
 
222 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  40.44 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  38.29 
 
 
249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.57 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  37.99 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  41.52 
 
 
235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  42.04 
 
 
227 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  39.46 
 
 
233 aa  171  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  37.89 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  43.44 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  37.22 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  38.57 
 
 
237 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  38.12 
 
 
231 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  37.27 
 
 
255 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  39.73 
 
 
256 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1518  ABC transporter related  44.14 
 
 
222 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  42.15 
 
 
221 aa  169  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  37.39 
 
 
231 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
230 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 
237 aa  169  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  42.86 
 
 
228 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
252 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  41.18 
 
 
243 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
221 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.39 
 
 
234 aa  168  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  39.11 
 
 
240 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2383  ABC transporter related  45.21 
 
 
221 aa  168  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.36 
 
 
227 aa  168  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2429  ABC transporter related  45.21 
 
 
221 aa  168  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.47836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.5 
 
 
237 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.5 
 
 
237 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.57 
 
 
230 aa  167  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
250 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
228 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.53 
 
 
604 aa  167  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  41.26 
 
 
223 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  37.44 
 
 
228 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 
408 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  37.22 
 
 
228 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.97 
 
 
649 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  39.19 
 
 
225 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.07 
 
 
648 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  40.36 
 
 
225 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  38.39 
 
 
246 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  36.87 
 
 
228 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  38.91 
 
 
237 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  37.44 
 
 
231 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.97 
 
 
649 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.07 
 
 
646 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.07 
 
 
648 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.07 
 
 
648 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>