More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0080 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  4.23872e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  3.59666e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  126  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  126  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  125  2e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.23661e-11  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.09815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.31634e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  7.69266e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.50239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.60601e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.19097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.8346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.06677e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.87625e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.19555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.77018e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  81.69 
 
 
83 aa  121  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.20042e-14  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  77.78 
 
 
72 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  119  1e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.27108e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  85.29 
 
 
71 aa  119  2e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  2e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.17845e-06  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.98783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 
73 aa  117  4e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  75 
 
 
72 aa  117  5e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  75 
 
 
85 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.52368e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  1e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  116  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  116  1e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  3.41025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  2e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  115  2e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.04366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
73 aa  115  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  1.64388e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  115  2e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0616  translation initiation factor 1  80.56 
 
 
72 aa  114  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  7.56585e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  4e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.35268e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  4e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  1.8307e-05  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  114  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  114  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.71749e-08  hitchhiker  4.19913e-09 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  70.83 
 
 
73 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  7e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  7.44837e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  7e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  8e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  113  8e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  113  1e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
75 aa  112  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.47738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  73.61 
 
 
72 aa  113  1e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
75 aa  112  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  112  2e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  112  2e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  112  2e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  2.65509e-05  hitchhiker  1.4317e-05 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  112  2e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 
73 aa  112  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.96746e-08  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
78 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
78 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  66.67 
 
 
87 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  111  4e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.18565e-13  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  2.87842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  68.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.63825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  68.49 
 
 
116 aa  110  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.32232e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.28141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  7e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 
72 aa  110  7e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  110  8e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
73 aa  110  8e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  110  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
72 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  71.23 
 
 
73 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  109  1e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1125  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  109  1e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.609417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  109  1e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1431  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  109  1e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1137  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  109  1e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1108  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  109  1e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 
74 aa  109  1e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  109  1e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  68.49 
 
 
73 aa  109  1e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  109  1e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.05996e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 
73 aa  109  1e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  109  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.56493e-07  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  69.86 
 
 
73 aa  109  1e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 
72 aa  108  2e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.2982e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>