289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0076 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
59 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  93.1 
 
 
60 aa  111  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  81.36 
 
 
59 aa  92  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  68.97 
 
 
59 aa  78.2  4e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  68.97 
 
 
59 aa  78.2  4e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 
60 aa  76.3  1e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 
60 aa  74.3  6e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.01439e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.11905e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.62232e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.814e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
60 aa  73.6  9e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.37518e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 
60 aa  72.8  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.2367e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 
60 aa  72  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  60.34 
 
 
59 aa  72.4  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 
60 aa  72.4  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.38401e-09  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  58.62 
 
 
60 aa  71.6  3e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 
61 aa  71.2  4e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  58.62 
 
 
60 aa  70.5  7e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  61.02 
 
 
59 aa  70.5  8e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  58.62 
 
 
60 aa  70.1  1e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  58.62 
 
 
60 aa  69.7  1e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 
60 aa  70.1  1e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 
61 aa  69.7  1e-11  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 
60 aa  68.6  3e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.19229e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 
62 aa  68.6  3e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
61 aa  67.8  4e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 
60 aa  65.5  2e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  3.48111e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 
61 aa  65.5  2e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 
61 aa  65.5  2e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 
59 aa  65.9  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  53.45 
 
 
60 aa  65.5  3e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  57.14 
 
 
62 aa  64.3  5e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 
62 aa  64.3  5e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
60 aa  64.3  5e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 
60 aa  64.3  6e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
59 aa  63.9  8e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 
60 aa  63.5  9e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  8.66459e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
61 aa  63.5  9e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  1.28267e-05  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  52.73 
 
 
61 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  55.17 
 
 
59 aa  63.2  1e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  8.36724e-05  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  53.45 
 
 
60 aa  62.8  1e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 
62 aa  63.5  1e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  63.2  1e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  63.2  1e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  48.28 
 
 
60 aa  62.4  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 
61 aa  62  2e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  6.57277e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  51.72 
 
 
58 aa  62  2e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.60316e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 
60 aa  62.4  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  53.45 
 
 
60 aa  62.4  2e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  51.72 
 
 
60 aa  62.4  2e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  50 
 
 
61 aa  62.4  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  61.6  3e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
59 aa  61.6  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.09135e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  61.6  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  61.6  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  61.6  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  61.6  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.35964e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  8.4288e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
59 aa  61.6  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.35954e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.88891e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
60 aa  62  3e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  2.43699e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  54.55 
 
 
63 aa  62  3e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.58772e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  53.45 
 
 
60 aa  62  3e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  52.73 
 
 
59 aa  62  3e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
59 aa  61.6  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
58 aa  61.6  4e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.99402e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  51.79 
 
 
59 aa  61.2  4e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
75 aa  61.6  4e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  6.50866e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
58 aa  61.6  4e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  61.2  4e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
65 aa  61.6  4e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.07725e-06  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  50.88 
 
 
58 aa  61.2  5e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  7.5211e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
59 aa  61.2  5e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.79323e-06  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  48.28 
 
 
60 aa  61.2  5e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  50 
 
 
60 aa  60.5  8e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
59 aa  60.1  9e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
62 aa  59.7  1e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.87774e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
56 aa  60.1  1e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 
61 aa  59.7  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 
63 aa  58.9  2e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  58.9  2e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.91615e-05  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
62 aa  58.9  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  4.91198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  46.55 
 
 
61 aa  58.5  3e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  48.21 
 
 
60 aa  58.5  3e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  52.83 
 
 
58 aa  58.5  3e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
59 aa  58.2  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.0093e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 
61 aa  58.2  4e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  54.39 
 
 
59 aa  58.2  4e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.93494e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 
65 aa  57.8  5e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>