More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0064 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  100 
 
 
217 aa  439  1e-122  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  95.39 
 
 
217 aa  421  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  88.48 
 
 
217 aa  399  1e-110  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  78.44 
 
 
218 aa  352  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  75.57 
 
 
221 aa  352  3e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.64619e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  76.61 
 
 
218 aa  344  7e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  342  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.33483e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.4199e-10  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.11227e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.35438e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.84364e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.4584e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.65133e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.78645e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  340  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.51619e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  74.89 
 
 
219 aa  338  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  6.2196e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 
217 aa  337  1e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.68649e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 
217 aa  337  1e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  72.81 
 
 
217 aa  335  4e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  71.49 
 
 
222 aa  328  5e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.59559e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  72.09 
 
 
226 aa  324  7e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  68.16 
 
 
223 aa  302  2e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  63.93 
 
 
219 aa  299  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  65.74 
 
 
219 aa  298  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  64.22 
 
 
221 aa  295  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.49554e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  65.6 
 
 
226 aa  295  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  63.64 
 
 
220 aa  287  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  62.84 
 
 
218 aa  287  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  64.62 
 
 
222 aa  286  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.20467e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  64.32 
 
 
238 aa  283  1e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  65.88 
 
 
220 aa  281  4e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  63.16 
 
 
214 aa  281  7e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  61.57 
 
 
219 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.78065e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  60.58 
 
 
229 aa  277  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  63.38 
 
 
267 aa  276  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  5.07952e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  61.03 
 
 
222 aa  274  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  61.03 
 
 
222 aa  274  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  58.65 
 
 
224 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  58.65 
 
 
224 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  58.65 
 
 
224 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  60.66 
 
 
262 aa  269  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 
211 aa  269  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  60.91 
 
 
222 aa  268  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.2444e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 
210 aa  267  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 
211 aa  266  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.77184e-14 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  57.69 
 
 
224 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 
211 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 
211 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.11736e-06  hitchhiker  1.69292e-09 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  59.72 
 
 
260 aa  265  3e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  6.49383e-06 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  63.46 
 
 
228 aa  265  3e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  59.81 
 
 
241 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 
210 aa  264  6e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  57.77 
 
 
278 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  57.62 
 
 
210 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.89266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  59.13 
 
 
395 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 
221 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.5133e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  56.67 
 
 
302 aa  261  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  56.67 
 
 
272 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  57.97 
 
 
223 aa  260  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  57.77 
 
 
292 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 
227 aa  258  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.03 
 
 
223 aa  257  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 
278 aa  257  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  60.1 
 
 
226 aa  256  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.16647e-06  unclonable  3.59419e-12 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 
278 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  9.91742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  57.89 
 
 
230 aa  255  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 
223 aa  255  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  6.95636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 
224 aa  255  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  1.34918e-06 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  58.22 
 
 
278 aa  254  5e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.52723e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 
226 aa  254  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 
278 aa  254  8e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  53.81 
 
 
341 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
230 aa  254  1e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.84252e-09  unclonable  7.95871e-06 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
235 aa  253  1e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 
243 aa  253  1e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  56.1 
 
 
288 aa  253  1e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  54.46 
 
 
288 aa  253  2e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 
243 aa  252  2e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 
240 aa  253  2e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 
275 aa  253  2e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  1.22787e-08  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  54.46 
 
 
288 aa  253  2e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  55.61 
 
 
270 aa  253  2e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
228 aa  252  2e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  56.6 
 
 
268 aa  252  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 
325 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 
210 aa  252  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.77493e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  55.19 
 
 
272 aa  252  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 
228 aa  251  4e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  57.97 
 
 
249 aa  251  4e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  55.29 
 
 
286 aa  252  4e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 
229 aa  252  4e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.2982e-06  decreased coverage  4.84078e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  58.69 
 
 
228 aa  251  5e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  55.34 
 
 
279 aa  251  5e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  58.69 
 
 
228 aa  251  5e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 
233 aa  251  5e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.8862e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
232 aa  251  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.78804e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
232 aa  251  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.36971e-08  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
232 aa  251  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.55466e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0391  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 
252 aa  251  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>