More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0061 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  96.75 
 
 
277 aa  548  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  81.52 
 
 
276 aa  463  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  76.09 
 
 
276 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  75.72 
 
 
276 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  74.28 
 
 
276 aa  434  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  74.28 
 
 
276 aa  434  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  74.64 
 
 
276 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  76.53 
 
 
277 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  76.53 
 
 
277 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  75.45 
 
 
277 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  73.91 
 
 
276 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  74.09 
 
 
278 aa  416  1e-115  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4721e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  71.74 
 
 
281 aa  400  1e-110  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.49234e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  68.59 
 
 
276 aa  398  1e-110  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  68.59 
 
 
277 aa  395  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  69.2 
 
 
276 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 
279 aa  386  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  2.63643e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  67.5 
 
 
281 aa  387  1e-106  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  69.68 
 
 
281 aa  381  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.72816e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 
276 aa  381  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  64.77 
 
 
281 aa  383  1e-105  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  67.39 
 
 
276 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  64.87 
 
 
281 aa  381  1e-105  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  66.67 
 
 
276 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  5.61637e-06  decreased coverage  1.03379e-08 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 
275 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 
276 aa  371  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
275 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 
275 aa  368  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  65.22 
 
 
275 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  64.98 
 
 
275 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 
277 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 
277 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 
275 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  64.13 
 
 
276 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  63.54 
 
 
277 aa  364  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 
275 aa  362  5e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  64.96 
 
 
273 aa  356  2e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  64.62 
 
 
277 aa  355  6e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.95488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
274 aa  353  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 
280 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 
275 aa  349  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  60.79 
 
 
278 aa  347  9e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.62145e-06  hitchhiker  6.63071e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 
275 aa  347  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
275 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  6.88583e-06 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 
277 aa  342  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 
279 aa  339  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
283 aa  339  3e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0229  50S ribosomal protein L2  60.79 
 
 
279 aa  339  3e-92  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.116801  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
287 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
287 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  61.62 
 
 
287 aa  338  6e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  61.99 
 
 
287 aa  338  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
287 aa  337  1e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
277 aa  337  1e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  61.11 
 
 
287 aa  337  2e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
274 aa  336  3e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  60.22 
 
 
274 aa  333  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
274 aa  332  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 
287 aa  331  7e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
274 aa  330  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  59.78 
 
 
274 aa  330  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 
287 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
274 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 
275 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  5.85895e-08  hitchhiker  2.61127e-11 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 
275 aa  328  5e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.62377e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 
275 aa  328  5e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 
275 aa  328  5e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.64843e-09  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 
275 aa  328  5e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  5.85498e-10  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 
275 aa  328  5e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.14315e-06  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 
275 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.23883e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  55.72 
 
 
287 aa  327  1e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 
274 aa  326  2e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
287 aa  325  4e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
287 aa  324  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 
275 aa  324  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.80441e-05  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 
274 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
287 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 
275 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  3.26026e-05  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  56.09 
 
 
287 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3335  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 
275 aa  321  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  6.45842e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 
287 aa  320  1e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  58.91 
 
 
275 aa  320  2e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3773  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 
275 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  1.05761e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3743  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 
275 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  2.72978e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2629  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 
275 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  2.17343e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3166  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 
275 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  9.40413e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3801  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 
275 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0211596  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  63.24 
 
 
279 aa  320  2e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0252  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 
275 aa  319  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.67103e-05  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 
274 aa  319  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.06039e-07  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>