More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0059 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
207 aa  414  1e-115  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  94.2 
 
 
207 aa  390  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  76.44 
 
 
208 aa  320  7e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  62.32 
 
 
207 aa  276  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  61.84 
 
 
207 aa  273  9e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  9.84788e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  1e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  273  1e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  273  2e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  266  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 
207 aa  257  8e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  59.9 
 
 
207 aa  256  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.34967e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  59.9 
 
 
207 aa  256  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  9.811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  58.45 
 
 
205 aa  251  7e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.72593e-05  unclonable  1.97161e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  55.83 
 
 
207 aa  240  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  4.75036e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 
206 aa  221  5e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 
206 aa  211  8e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  48.31 
 
 
207 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 
207 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  50.72 
 
 
206 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 
208 aa  208  4e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 
207 aa  207  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.47375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 
207 aa  207  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 
206 aa  205  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  46.63 
 
 
208 aa  204  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 
204 aa  199  2e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 
208 aa  199  2e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.04234e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  199  2e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 
206 aa  199  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  50.24 
 
 
207 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  4.5126e-06  hitchhiker  1.48432e-09 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 
204 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  44.66 
 
 
207 aa  196  2e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  1.46284e-08 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 
207 aa  194  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  46.04 
 
 
223 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  47.09 
 
 
207 aa  193  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  47.29 
 
 
209 aa  191  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  43.96 
 
 
207 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 
208 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 
206 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  43 
 
 
207 aa  184  1e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.03747e-05  hitchhiker  2.67396e-11 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  42.08 
 
 
221 aa  183  2e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17748e-06 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  44.93 
 
 
208 aa  182  2e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 
206 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  40.59 
 
 
223 aa  182  4e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  45.19 
 
 
208 aa  182  4e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.38717e-07  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  45.67 
 
 
209 aa  181  5e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  43.44 
 
 
221 aa  180  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.11144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 
206 aa  177  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.29639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  46.63 
 
 
207 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 
206 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.69503e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  42.51 
 
 
207 aa  174  1e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
206 aa  174  1e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 
222 aa  173  2e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  39.82 
 
 
221 aa  171  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
207 aa  168  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 
218 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 
210 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 
208 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.40203e-05  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 
206 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  3.84651e-12  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 
210 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  5.86581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  39.22 
 
 
209 aa  165  3e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 
208 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 
206 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 
212 aa  164  7e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 
209 aa  164  7e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  6.71055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 
201 aa  164  1e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  8.76425e-08  hitchhiker  7.26358e-06 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  40.54 
 
 
223 aa  164  1e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.24266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  44 
 
 
209 aa  162  2e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 
220 aa  163  2e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.30014e-06  hitchhiker  3.1805e-13 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  43.46 
 
 
219 aa  162  2e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
209 aa  163  2e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
211 aa  163  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
211 aa  163  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 
208 aa  162  2e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  42.29 
 
 
201 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.59231e-05  unclonable  4.48849e-12 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
208 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 
214 aa  162  4e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0872  50S ribosomal protein L4  45.31 
 
 
201 aa  161  5e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 
206 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  40.78 
 
 
209 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 
208 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  41.5 
 
 
216 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 
206 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 
210 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  41 
 
 
248 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 
208 aa  158  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 
201 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.71014e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 
201 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.24791e-05  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3635  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 
201 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00226471  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3743  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 
201 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.0176443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 
201 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 
201 aa  158  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.09628e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>