More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0056 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  100 
 
 
412 aa  808  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  55.69 
 
 
429 aa  416  1e-115  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  45.23 
 
 
429 aa  332  8e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
459 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
464 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
464 aa  153  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.71 
 
 
450 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
450 aa  149  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
450 aa  147  4e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
475 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  1.56724e-11  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
458 aa  133  7e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
459 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.35028e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
456 aa  130  4e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.80901e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.33 
 
 
469 aa  129  1e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.59 
 
 
463 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  6.27796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.98 
 
 
453 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.76954e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  27.64 
 
 
446 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
495 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.35228e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.18 
 
 
484 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.3845e-09  hitchhiker  3.34983e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.18 
 
 
547 aa  122  1e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.18 
 
 
547 aa  122  1e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  25.18 
 
 
484 aa  122  1e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.99298e-08  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.18 
 
 
546 aa  122  1e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.0697e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.94 
 
 
495 aa  121  2e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.39345e-07  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
446 aa  122  2e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.92 
 
 
452 aa  121  2e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.18 
 
 
546 aa  121  2e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
469 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
442 aa  120  4e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.74233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  26.75 
 
 
478 aa  120  4e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
446 aa  120  5e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.23642e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
461 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.5823e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  25.42 
 
 
446 aa  119  8e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
483 aa  119  1e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
454 aa  118  1e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.47 
 
 
464 aa  118  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  9.23462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.46 
 
 
463 aa  118  2e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
445 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
464 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  23.24 
 
 
446 aa  117  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
464 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.17655e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  26.81 
 
 
446 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  24.41 
 
 
464 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  6.55029e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  24.41 
 
 
464 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.60081e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.41 
 
 
464 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.25629e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  24.41 
 
 
464 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.4435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
464 aa  115  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
464 aa  115  2e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.71 
 
 
474 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.75 
 
 
470 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.71 
 
 
474 aa  113  7e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.35 
 
 
474 aa  113  7e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  25.47 
 
 
476 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  25.85 
 
 
476 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  26.51 
 
 
502 aa  112  1e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  26.2 
 
 
439 aa  111  2e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.12 
 
 
464 aa  110  4e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.38189e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
468 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  22.93 
 
 
440 aa  109  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.03 
 
 
462 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.77 
 
 
445 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.31388e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.5 
 
 
454 aa  106  7e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  23.24 
 
 
480 aa  106  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
447 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.05 
 
 
462 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  3.17216e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.84 
 
 
468 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  6.78206e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
464 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  25.17 
 
 
439 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.51 
 
 
475 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
447 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  22.59 
 
 
453 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.54468e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  23.91 
 
 
484 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
448 aa  99.8  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.66798e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.27 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.94 
 
 
440 aa  96.7  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  19.71 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.66 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
460 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  22.89 
 
 
467 aa  93.6  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  24.47 
 
 
453 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.05 
 
 
555 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  20 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  21.26 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
458 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.8929e-07 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  23.15 
 
 
462 aa  90.1  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  21.78 
 
 
469 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  21.78 
 
 
469 aa  90.1  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  21.81 
 
 
468 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.02645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  23.02 
 
 
456 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.99 
 
 
469 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  19.77 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  24.65 
 
 
458 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  19.77 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  19.77 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  20 
 
 
469 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  23.09 
 
 
461 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>