249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0055 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2405  threonine synthase  63.6 
 
 
496 aa  640  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.943619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0055  threonine synthase  100 
 
 
496 aa  1018  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0196788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1857  threonine synthase  72.06 
 
 
494 aa  728  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.228698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3511  threonine synthase  55.53 
 
 
499 aa  559  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.29411e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1076  threonine synthase  52.34 
 
 
495 aa  486  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  6.88351e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0787  threonine synthase  50.41 
 
 
485 aa  481  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.456403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  49.1 
 
 
499 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1450  threonine synthase  49.7 
 
 
507 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.628266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0281  threonine synthase  47.99 
 
 
498 aa  467  1e-130  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  4.57965e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1302  threonine synthase  47.48 
 
 
500 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1545  threonine synthase  48.17 
 
 
487 aa  459  1e-128  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0958  threonine synthase  47.89 
 
 
499 aa  458  1e-128  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0625228  normal  0.0974389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0786  threonine synthase  48.99 
 
 
496 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1379  threonine synthase  47.48 
 
 
499 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00539056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  49.57 
 
 
497 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  47.59 
 
 
500 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0539  threonine synthase  48.15 
 
 
502 aa  433  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0259397  unclonable  2.59641e-08 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1019  threonine synthase  45.25 
 
 
508 aa  427  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3053  threonine synthase  45.34 
 
 
494 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16070  threonine synthase  45.16 
 
 
490 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0278928  hitchhiker  2.94032e-07 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0655  threonine synthase  45.33 
 
 
493 aa  408  1e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23828e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14820  threonine synthase  40.59 
 
 
504 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.312507  normal  0.0904942 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13040  threonine synthase  45.5 
 
 
516 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0950909  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0567  threonine synthase  45.23 
 
 
522 aa  357  4e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1249  threonine synthase  39.26 
 
 
491 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0878389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1352  threonine synthase  39.51 
 
 
498 aa  310  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0789  threonine synthase  37.71 
 
 
490 aa  299  9e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  40.77 
 
 
471 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  40.23 
 
 
465 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  40.32 
 
 
474 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  38.22 
 
 
470 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  38.67 
 
 
472 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  38.67 
 
 
472 aa  285  1e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  38.67 
 
 
472 aa  284  2e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  38.18 
 
 
468 aa  284  2e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  38.1 
 
 
471 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  36.74 
 
 
470 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  36.4 
 
 
580 aa  281  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  37.73 
 
 
463 aa  280  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  37.73 
 
 
463 aa  280  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  39.68 
 
 
459 aa  279  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  38.86 
 
 
472 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  38.39 
 
 
476 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  38.81 
 
 
465 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  37.14 
 
 
472 aa  276  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  36.38 
 
 
473 aa  275  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2052  threonine synthase  35.81 
 
 
487 aa  275  1e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00798394  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  40.63 
 
 
435 aa  275  2e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  38.22 
 
 
467 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  38.46 
 
 
463 aa  273  4e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  37.05 
 
 
504 aa  273  6e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  37.02 
 
 
470 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  36.77 
 
 
471 aa  270  3e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  36 
 
 
470 aa  270  3e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  38.53 
 
 
461 aa  271  3e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  9.88233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  36.16 
 
 
453 aa  270  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0130  threonine synthase  36.33 
 
 
487 aa  269  7e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  36.59 
 
 
465 aa  269  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  35.78 
 
 
470 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  36.7 
 
 
461 aa  266  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  38.07 
 
 
458 aa  266  9e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0902  threonine synthase  37.08 
 
 
469 aa  264  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0582732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  36.22 
 
 
470 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  37.87 
 
 
469 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  35.91 
 
 
463 aa  263  5e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  37.42 
 
 
469 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  37.93 
 
 
460 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.35451e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  36.59 
 
 
462 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  37.64 
 
 
469 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  37.87 
 
 
469 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  37.5 
 
 
469 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  38.07 
 
 
458 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  6.09388e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  36.4 
 
 
465 aa  260  5e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  38.75 
 
 
460 aa  259  5e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  2.45714e-08 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  36.28 
 
 
463 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  37.64 
 
 
469 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  36.05 
 
 
466 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  37.78 
 
 
469 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  35.76 
 
 
471 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  37.78 
 
 
469 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  37.78 
 
 
469 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  37.64 
 
 
469 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  36.55 
 
 
460 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1020  threonine synthase  34.69 
 
 
476 aa  258  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  36.01 
 
 
461 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.11335e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  35.6 
 
 
461 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.2 
 
 
471 aa  256  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  37.67 
 
 
469 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  35.37 
 
 
461 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  36.22 
 
 
461 aa  254  2e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  37.87 
 
 
432 aa  254  2e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  36.43 
 
 
465 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  36.84 
 
 
511 aa  252  9e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  37.47 
 
 
461 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  36.63 
 
 
470 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  33.95 
 
 
475 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  34.95 
 
 
476 aa  249  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  34.95 
 
 
476 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  33.78 
 
 
462 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  35.54 
 
 
481 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>