More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0049 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
332 aa  672  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.35 
 
 
318 aa  585  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.98 
 
 
333 aa  534  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.62 
 
 
339 aa  437  1e-122  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.02 
 
 
338 aa  433  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 
338 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
351 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.96 
 
 
333 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
336 aa  416  1e-115  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.69292e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
336 aa  416  1e-115  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.76232e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 
333 aa  417  1e-115  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
333 aa  414  1e-115  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.48871e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
336 aa  416  1e-115  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
333 aa  415  1e-115  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 
333 aa  417  1e-115  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
333 aa  416  1e-115  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.30982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.74 
 
 
541 aa  415  1e-115  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9576e-05 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 
345 aa  415  1e-115  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.35 
 
 
333 aa  416  1e-115  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.01371e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 
333 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.39422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 
342 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 
333 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.59024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 
345 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
346 aa  406  1e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 
334 aa  405  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
357 aa  405  1e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
334 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 
344 aa  407  1e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
334 aa  405  1e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 
334 aa  405  1e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 
334 aa  407  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 
335 aa  407  1e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
346 aa  405  1e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
334 aa  405  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 
334 aa  407  1e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
334 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  7.44022e-08 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
341 aa  407  1e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 
334 aa  407  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  4.99721e-05  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 
355 aa  404  1e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.62975e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 
338 aa  405  1e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 
334 aa  405  1e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.80468e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 
334 aa  407  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 
334 aa  407  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.59876e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
357 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
354 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
354 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
363 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 
338 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.49 
 
 
336 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 
334 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.2467e-05  hitchhiker  4.32146e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 
358 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
357 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
334 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 
334 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
337 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
337 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
348 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.67 
 
 
336 aa  401  1e-110  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
334 aa  400  1e-110  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 
344 aa  399  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.98 
 
 
338 aa  399  1e-110  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
334 aa  400  1e-110  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 
353 aa  398  1e-110  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 
334 aa  399  1e-110  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 
336 aa  398  1e-110  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
337 aa  398  1e-110  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 
335 aa  398  1e-110  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.68947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
354 aa  399  1e-110  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
358 aa  401  1e-110  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
338 aa  400  1e-110  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 
336 aa  398  1e-110  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.37 
 
 
338 aa  400  1e-110  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 
347 aa  400  1e-110  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 
334 aa  398  1e-110  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.54774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 
337 aa  399  1e-110  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
336 aa  400  1e-110  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 
334 aa  398  1e-110  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
334 aa  400  1e-110  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
356 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 
355 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 
354 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 
356 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 
336 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
356 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
356 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 
336 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
356 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
356 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 
351 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 
348 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
356 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 
356 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 
336 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.47105e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
356 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 
343 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 
350 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
336 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>